После обновления битрикса стали отправляться 2 письма о заказе, опытным путем выяснил, что скорее всего дело в кастомном компоненте sale.order.ajax, новый компонент судя по коду не отправляет события, а отправляется оно откуда-то еще. Возникает вопрос откуда происходит вызов отправки шаблона вне компонента?