Вот недавно редактировал футер, изменения внес несовсем большие. Проблема в том что в шаблоне футера есть закрывающие теги :</BODY> </HTML> а на самой странице в коде не отображаются. Тоесть фактически теги отсутствуют.
Большая доля вероятности, что до вывода </BODY> </HTML> имеется ошибка (возможно отсутствует к.л. функция или класс). Соответственно, всё, что идёт после не отображается. Попробуйте включить отображение ошибок в файле /bitrix/php_interface/dbconn.php