Приложения работаю на рест методах, но методы так же доступны и сами по себе Если у вас есть своя система способная формировать запросы, вы можете писать скрипты там, которые будут запускаться от исходящего из бп вэбхука и будут использовать рест методы для нужных вам изменений
В настройках главного модуля найдите раздел "Панель инструментов публичного раздела" Там задаются права на админ панель в публичной части, возможно у вас они привязаны к структуре и соответственно её изменения повлияли
По идее права администратора действительно не обязательны для этого, постановщик обладает максимальными правами на задачу, если у вас не так, то что то кастомизировали или настраивали