В IBLOCK_SECTION_NAME_* вместо * ставьте уровни иерархии групп инфоблока подразделений: 1, 2 и т.д.
В качестве значения - названия подразделений.
На втором шаге импорта укажите привязку к инфоблоку подразделений.
В качестве значения - названия подразделений.
На втором шаге импорта укажите привязку к инфоблоку подразделений.