У меня предположение что баг проявляет себя при записи предложения, "Элемент каталога" или CML2_LINK указывает на родителя, так вот происходит так что родитель как ни странно до записи не подставляется. И это происходит имеено в битриксовом хламокоде, т.к. ограничения в базе данных они практически не используют.