Вариантов несколько
1. Разделение на уровне инфоблоков (неудобно, надо копировать свойства)
2. Разделение на уровне разделов
3. Разделение на уровне свойств
Во втором случае нужно будет добавить столько корневых разделов, сколько у вас регионов. Потом раскидать по этим разделам ваши элементы. Но если у вас сложная структура каталога (глубокая вложенность разделов), то это не очень удобно - придется копировать структуру каталога в каждый регион.
Третий случай легче всего реализовать. Создаете свойство типа список, в варианты записываете ваши регионы (не забудьте поставить галочку "свойство участвует в поиске). Потом на странице списка добавляете фильтр по этому свойству.
Если необходимо разделить несколько инфоблоков по регионам, то лучше сделать свойство "привязка к элементам", создать отдельный инфоблок для регионов, к которому привязать свойство.