Василий, можно несколько глупых вопросов?
0. Пробовали не в корень админки попадать, а куда нить на страницу настроек модулей или в статистику?
1. Какой браузер?
2. Опишите виртуальную машину, это образ виртуалки от битрикса или сами на xen или virtualbox и аналогах создаете с нуля?
3. Из бекапа вы что восстановили? Просто через скрипт сайт подняли?
4. У вас есть данные в бд? Я имею виду наполнение сайта?
5. Смотрели консоль браузера? Лог ошибок php, сервера, mysql?
6. И совсем глупый вопрос-вариант - проверяли на вирусы?
Я понимаю, мы тут не глупые люди, но вдруг не мне так вам или еще кому то что то покажется странным в ваших ответах и найдется ответ.
При отсутствии наполнения БД, я бы попробовал просто руками с рабочего варианта перенести шаблоны скрипты периодически проверяя работоспособность.