Где находятся отдельные настройки php?

Нужная Вам директива указана в /etc/php.d/bitrixenv.ini
Изменять значенния директив разработчики рекомендуют путем создания файла /etc/php.d/z_bx_custom_settings.ini и указания в оном нужных настроек, т.е. Вам необходимо создать файл и указать в нем нужное значение:
sendmail_path = ...

Если у вас несколько сайтов, и требуется разные значения директивы для разных сайтов, то можно задать значение в конфиге апача для нужного сайта в /etc/httpd/bx/conf/*