Простите, Александр, за задержку с ответом.
Нет, использование собственных шаблонов для редактирования разделов/групп инфоблока невозможно. Мы не видим необходимости в подключении таких шаблонов прежде всего из-за того, что у разделов отсутствуют свойства, имеющиеся у элементов.
Сам шаблон дает только удобный интерфейс, реализация же свойств для раздела должна быть произведена на уровне модуля, а этого в данный момент нет.
Мы обсуждали возможность реализации свойств групп раздела, но точно можем сказать, что в ближайшее время этого сделано не будет.
В принципе, возможна следующая реализация:
создаете еще один инфоблок, определяете в нем свойство привязка к разделам" и создаете несколько элементов, описывающих группы. Понятно, что с Вашей стороны должно быть обеспечено правило: "один элемент инфоблока описаний для одной группы, которую необходимо описывать".
И при выводе группы делаете дополнительную выборку элементов по другому инфоблоку, инфоблоку описаний.