Нужно повесить обработчик на клик по галочке сравнить, будет обновлять блок который в шапке, то есть получать актуальное состояние и количество в сравнении.
Не удаляются файлы из множественного поля типа Файл
Выводилась такая же ошибка. Дело было в закладке "Характеристики товара, добавляемые в корзину", после того как убрал все поля оттуда все заработало. У меня комплексный компонент каталога bitrix:catalog