Вы не указали, что за у вас проблема. Но я столкнулся с тем, что при запуске тестов через phpunit получаю сообщения о не найденных классах. Причина в том, что битрикс использует __autoload, а phpunit - spl_autoload_register(). Решение - в самом начале файла с тестом объявить константу: define('NO_BITRIX_AUTOLOAD', true);