По умному, должен корректно отрабатывать агент, который чистит эту таблицу. Но увы, в старых версиях ядра такого не происходит, и причины могут быть разные (от кривого кода в кастомных компонентах, до кривого кода в ядре). Недавно видел в обновлениях главного модуля исправление каких-то проблем с кэшированием.
Кстати, в моем случае (5М записей в таблице b_cache_tag) не возможно было обновить элемент в инфоблоке.
Кстати, в моем случае (5М записей в таблице b_cache_tag) не возможно было обновить элемент в инфоблоке.