Влад, к сожалению на данный момент привязка товаров к группам действительно сохраняется.
В описании имелось в виду, что вы можете изменить структуру разделов и подразделов.
Мы обсудим ваше требование и, возможно, добавим такую возможность в ближайших обновлениях 1С-Битрикс. Пока я рекомендую вам обратиться в техподдержку, где запросить вариант кастомизации импорта, при котором привязка к группе не перезаписывается новыми данными из 1С.
В описании имелось в виду, что вы можете изменить структуру разделов и подразделов.
Мы обсудим ваше требование и, возможно, добавим такую возможность в ближайших обновлениях 1С-Битрикс. Пока я рекомендую вам обратиться в техподдержку, где запросить вариант кастомизации импорта, при котором привязка к группе не перезаписывается новыми данными из 1С.