После апдеита PHP на хостингах создастся такая проблема. Это вызвана тем что в PHP добавили свойство max_input_vars, который ровен 1000 по дефолту, что для Битрикс зачастую бывает мало. Вы должны изменить этот параметр в php.ini или в .htaccess. За одно проверьте активны ли все свойства.