Ну как не панацея, сначала ты подключаешь jquery, потом расширяешь его плагинами, а потом переопределяешь новым jquery. Поэтому все плагины и слетают.
Так что <?$APPLICATION->ShowHead();?> выше собственных подключений - вполне себе вариант.
Или так: поключаем jquery, потом <?$APPLICATION->ShowHead();?>, а уже потом все плагины типа fancybox(он, кстати, слетел скорее всего по вышеуказаной причине, а не потому что версия не та).
Так что <?$APPLICATION->ShowHead();?> выше собственных подключений - вполне себе вариант.
Или так: поключаем jquery, потом <?$APPLICATION->ShowHead();?>, а уже потом все плагины типа fancybox(он, кстати, слетел скорее всего по вышеуказаной причине, а не потому что версия не та).