Здравствуйте!
Попробуйте в ссылке передавать параметры вот так:
<a href="/ajax_popup.php?SECTION_ID=<?=$arItem["IBLOCK_SECTION_ID"]?>&ELEMENT_ID=<?=$arItem["ID"]?>" class="popup"><?=GetMessage("QUICK_SHOW")?></a>
Попробуйте в ссылке передавать параметры вот так:
<a href="/ajax_popup.php?SECTION_ID=<?=$arItem["IBLOCK_SECTION_ID"]?>&ELEMENT_ID=<?=$arItem["ID"]?>" class="popup"><?=GetMessage("QUICK_SHOW")?></a>