А у меня такая же проблема была из-за того что я по "умности" думал что при настройке выгрузки в файл или просто обмена между сайтом ставил галочку напротив "Номенклатура". Оказывается это фильтр выгрузки и если его не заполнять то он и выдаёт пустоту.