Евгений Жуков (Все сообщения пользователя)

global   $arrFilter ;

$arrFilter[] = [
   'LOGIC' => 'OR',
    [
       '=CATALOG_TYPE' => \Bitrix\Catalog\ProductTable::TYPE_PRODUCT,
       '>CATALOG_STORE_AMOUNT_3' => 0 // 3-й склад
    ],
    ['!=CATALOG_TYPE' => \Bitrix\Catalog\ProductTable::TYPE_PRODUCT]
]
 $arrFilter [ 'OFFERS' ][ '>CATALOG_STORE_AMOUNT_3' ] =  0 ;  // проверяем склад с ID = 3

global $arrFilter;

$arrFilter['OFFERS']['>CATALOG_STORE_AMOUNT_3'] = 0; // проверяем склад с ID = 3

$APPLICATION->IncludeComponent('bitrix:catalog',
   'ваш_шаблон',
   array(
       ... 
       'FILTER_NAME' => 'arrFilter',
       ....
   ),
   ....
);