Алена, Александр, выше, годную идею подсказал =) Если у вас установлены готовые решения из Маркетплейса, то там, чаще всего, код счетчиков можно указать в настройках модуля этого самого готового решения.
Если же это сторонние шаблоны, то код счетчика может быть абсолютно где угодно.
Я вам подскажу, как найти его. Думаю, трудности не возникнет.
1. Для начала, найдите его расположение по исходному коду.
2. Откройте текущий шаблон сайта и найдите этот участок кода, или рядом с ним.
3. Если напрямую в шаблоне вы код не обнаружили (как вы писали в самом начале), то он встраивается либо из подключаемых файлов, либо из компонентов.
По идее на месте, где по коду должен находиться счетчик, у вас будет как раз либо подключаемый файл, либо компонент. Если это файл, то тут всё просто - проходите по указанному пути в этот файл и сносите счетчик. Если это компонент, то смотрите название его шаблона, идете в папку этого шаблона и шерстите файлы на наличие кода счетчика.