Проблема решилась, установкой модуля выгрузки от Битрикс 4.1.0.3, еще заметил такую вещь, если в УТ не указана ед. измерения при регистрации штрих кода, т.е. штрих код зарегистрирован для товара, но не стоит ед. изм. (шт, м. и т.д.), то штрихкод на сайт не выгружается.
Еще заметил одну закономерность, если в УТ не указан вес в товаре (в Упаковках), то не грузится цена товара.
Еще заметил одну закономерность, если в УТ не указан вес в товаре (в Упаковках), то не грузится цена товара.