Увеличивайте max_input_vars, или сразу используйте BitrixVM - подобных вопросов не будет появляться.
Важная информация по модулям обмена, В этой теме будет выкладываться интересная и важная информация по модулям обмена с 1С:Предприятие. Просьба не флудить.
Развернул БУС и 1С снуля, обновился до УТ 11.3.4.21, поставил обработочку 7.0.1.3, номенклатура выгружается, цены - нет. При переключении на выгрузку в файлы, файлы prices и rests: