Я прошу прощения, я конечно не мастер в Битриксе, но делал похожую задачу у себя в конторе. Вообщем могу предположить что сама кнопка формирования отчета ссылается на иной файл, тоесть сама страница верна (/bitrix/admin/reports/invoice.php) но на этой странцие кнопка формирования отчета попрежнему ссылается на bitrix\modules\sale\ru\reports....Если не помог звыняйте 
