У меня та же история. Пришлось кое чего поправить. В файле /bitrix/modules/main/jscore.php
/* external libs */ в этом блоке
- прописал свои предыдущие версии, можно из CDN, но я просто взял из бэкапа этот файл и предыдущие пути из него, новые оставил, а после них поставил свои предыдущие. Ну и соответственно путям загрузил сами скрипты из бэкапа. Можно из CDN - кому как. Но это не выход я думаю разработчики bitrix решат эту проблему – ждем и надеемся…