apc.ttl больше нуля для очистки памяти от старых скриптов на VM установленно в 7200
apc.shm_size устанавливается в зависимости от объема памяти
apc.filters=\"-/bitrix/cache/,-/bitrix/managed_cache/,-/bitrix/stack_cache/,-/bitrix/local_cache/,-/upload/\"
apc.num_files_hint=20000
apc.user_entries_hint=20000
это основные измения в настройках