Спасибо за ответ,
Создание отдельных пользователей в системе и СУБД для каждого клиента(экземпляра) и настройка Apache Vhosts на домашние директории созданных пользователей.
Каждый отдельный экземпляр Битрикс, как я понимаю, нужно устанавливать в корень VHohst'a.
таким образом безопасность на уровне БД достигается путем разных учетных записей в СУБД для каждого экземпляра.
а безопасность файловых структур обеспечивается тем, что пользователи по умолчанию не могут читать\модифицировать содержимое домашних каталогов других пользователей.
все верно?