То что будет две выгрузки, это понятно. Если не ошибаюсь, комментарии к заказам у вас разные будут, уже отфильтровать можно. + в свойства заказов можно свой признак выгружать. Имея две такие зацепки можно дальше (но это уже не штатно) и префикс подставлять и что угодно сделать можно. Ну и вопрос попутно, обмен с битриксом у вас работает "как часы", а сам учет товаров в магазине тоже работает "как часы" на 11-й то УТ? УТ 11 настолько у вас удачно работает что даже с поддержки снимать ее не пришлось?
@reider_pnz