Имеется один интернет-магазин и несколько физических( в каждом ведется своя база ). Можно ли интегрировать магазин со всеми базами вместе, чтобы была строка "наличие в магазине X"?
Да, это возможно. Нужно будет создать по одной странице на сайте для каждой базы 1С и поместить на нее и настроить компоненты обмена с 1С. Ну и соответственно в 1С установить ссылки на эти страницы как страницы обмена.