Антон Иванов, обновления движка актуальны?
это чего такое? /bitrix/admin/on.php
похоже штатным аплоадером fileman_file_upload.php загрузили бэкдор - вопрос почему ему доступ был предоставлен, тут нужно изучать ...
в fileman_file_upload.php первая же строчка
$USER->CanDoOperation('fileman_upload_files')
т.е. при обращени юзер был авторизован
в скрипте пролог сначала подрубается, получается если сайт ранее был взломан, инъекцию могли добавить в любое место, где цепляется
require_once($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/modules/main/include/prolog_admin_before.php");
require_once($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/modules/fileman/prolog.php");
а это очень много куда можно прицепиться ... например, банально опрос какого нить заголовка и $USER->autorize(); если он есть
ещё вариант - утащили авторизационные данные, либо сессионные данные т.е. запрос изначально штатно авторизованный прилетел