Форум

//$arResult["ID"] - ID раздела

foreach(CIBlockSectionPropertyLink::GetArray($arResult["IBLOCK_ID"], $arResult["ID"]) as $PID => $arLink)  {
    if($arLink["SMART_FILTER"] !== "Y")
            continue;

    $arResult["SMART_FILTER_PROPERTY"][] = $PID;
}
//$arResult["SMART_FILTER_PROPERTY"] - будет содержать ID свойств с флагом "Показывать в умном фильтре"