Задавал этот вопрос тех. поддержке, ответа они не нашли!
Пришлось самому разбератся!
Возможно друзья у вас идут суммы не в "Безналичный", а в "Кредит" ... Я заметил это в чеке! А в Битрикс "Кредитные" оплаты не отображаются никак! Поэтому все по нолям!
Не знаю с чем связано, но если у вас оплаты через сайт настроен Эквайринг ... выбирайте не цифру 4 в настройках ККМ "Оплаты", а цифру 2 - это Электронные. После этого в чеках суммы печатаются в оплаты ЭЛЕКТРОННЫЕ. В Z-отчет суммы встают в "Безнал" и "Выручка за день" формируется правильно! Такая же история в Битрикс z-отчете ... все фиксируется как нужно!