Думаю что можно.
Если очистить таблицы базы, то ID начнут отсчет сначала.
Перед этим нужно выгрузить содержимое инфоблока в файл и установить сортировку полей по номеру ID этого поля.
Наверняка в инфоблоке ID могли начинаться не с 1. Тогда нужно будет импортировать (если много записей) в инфоблок любые значения, чтобы "занять" ID до нужного (с которого начинались записи) и удалить их. Эти ID уже будут использованы и поэтому следующая загрузка нужных вам данных будет начинаться с первого незанятого ID и в том порядке как указана сортировка в файле загрузки.
Конечно, в одном инфоблоке ID записей могли прерываться (следовать не по порядку). Тогда можно в файле загрузки занять их любыми значениями. Но главное потом не забыть удалить. Собственно и первые ненужные ID можно автоматически заполнить при импорте любым значением. И соответственно удалить потом.
Как очистить именно нужные таблицы подсказать неберусь.