Если кто столкнется еще с такой проблемой, надо в настройках модуля "Управления структурой" (Настройки -> Настройки модулей -> Управление структурой) в разделе "Настройки для сайтов" прежде чем изменять список типов меню снять галочку "Использовать индивидуальные настройки для каждого сайта".
Затем вносите свои изменения, допустим, добавляете новый тип. Далее при создании меню в выпадающем списке он будет доступен.
Затем вносите свои изменения, допустим, добавляете новый тип. Далее при создании меню в выпадающем списке он будет доступен.