Те при загрузке с сайта заказа товар в нем удаляется. Или сначала приходит заказ, затем вы списываете в 1С и затем после обмена товар удаляется?
Быть может поможет убрать галочку Включить резервирование в настройках модуля битрикс торговый каталог?
Быть может поможет убрать галочку Включить резервирование в настройках модуля битрикс торговый каталог?