я бы наверно сделал так, указал скидку стандартным механизмом битрикс, потом в шаблоне компонента заменил код<?if($arPrice["DISCOUNT_VALUE"] < $arPrice["VALUE"]):?>
<s><?=$arPrice["PRINT_VALUE"]?></s>
<span class="catalog-price"><?=$arPrice["PRINT_DISCOUNT_VALUE"]?></span>
<?else:?><span style="color: red;"> <?=$arPrice["PRINT_VALUE"]?> </span><?endif;?>
на этот
<span style="color: red;"> <?=$arPrice["PRINT_VALUE"]?> </span>
чтобы не показывалась цена со скидкой