Сами по себе пользовательские свойства из Битрикса вы не выгрузите. Вы можете выгрузить весь инфоблок с пользовательскими свойствами, элементами, разделами. оно выгрузится в файл *.csv или *.xml. Это можно сделать Зайдя в Контент->инфоблоки->Экспорт и выбрать нужное. В результате у вас будет файл со всеми данными из инфоблока.