Есть несколько вариантов. Можно при добавлении товара в корзину функцией add2basket передать артикул в параметре arProductParams. Либо можно при оформлении заказа добавить новый параметр, но это, видимо придётся делать в шаблоне, потому как такого события вроде бы нет. Методы немного «грязные», может кто знает более элегантное решение.