Может, конечно, я не так понял задачу....
Но делалось так:
1. в корне создаём меню типа top
2. в папках создаём меню типа left
3. в подпапках создаём меню типа left (и так сколько надо)
4. в шаблоне вставляем компонент меню и указываем "Тип меню для первого уровня" - top, "Тип меню для остальных уровней" - left.
5. выбираем подходящий шаблон и кастомизируем его внешний вид.
В результате получается что меню верхнее всегда есть, а подменю раскрывается только у нужных папок.
Или что надо было получить? :)