Это, кроме сервера, ещё и от наиболее востребованных модулей на конкретном сайте зависит. Если будет много обращений к модулю, который делает 10 запросов к базе данных на одного посетителя - это одно, а если 100 - то это другое.
[ Закрыто] Доска обьявлений, Как сделать доску объявлений
Должен быть доступен. Возможно, путь к файлу нужно указать полностью. Например, $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . "/bitrix/templates/шаблон/popup.menu_include.php". Или же через GetFileRecursive();
Если действительно по каким-то причинам недоступен объект $APPLICATION, то его можно объявить как глобальный в этом месте: global $APPLICATION; - тогда точно будет доступен.
[ Закрыто] Доска обьявлений, Как сделать доску объявлений