Решение простое:
В файле /bitrix/modules/main/classes/general/backup.php
замените строку:
$data = file_get_contents($file);
на
$data = "\x1f\x8b\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\xff\xf f\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00";
В файле /bitrix/modules/main/classes/general/backup.php
замените строку:
$data = file_get_contents($file);
на
$data = "\x1f\x8b\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\xff\xf