Если я Вас правильно понял. В фильтре есть следующие свойства -
[LIST]
[*][B]SECTION_ID[/B] - по родительской группе. Если значение фильтра false, "" или 0, то будут выбраны элементы не привязанные ни к каким разделам. Иначе будут выбраны элементы привязанные к заданному разделу. Значением фильтра может быть и массив. В этом случае будут выбраны элементы привязанные хотя бы к одному из разделов указанных в фильтре. Возможно указание отрицания "!". В этом случае условие будет инвертировано;
[*][B]SECTION_CODE[/B] - по мнемоническому коду родительской группы. Аналогично SECTION_ID;
[/LIST]Добавляете их или одно из них в массив $arFilter в вашем примере по аналогии с [B]IBLOCK_ID [/B](в дополнение к нему) и ага. [url=http://dev.1c-bitrix.ru/api_help/iblock/classes/ciblockelement/getlist.php]В документации лучше описано.[/url]
[LIST]
[*][B]SECTION_ID[/B] - по родительской группе. Если значение фильтра false, "" или 0, то будут выбраны элементы не привязанные ни к каким разделам. Иначе будут выбраны элементы привязанные к заданному разделу. Значением фильтра может быть и массив. В этом случае будут выбраны элементы привязанные хотя бы к одному из разделов указанных в фильтре. Возможно указание отрицания "!". В этом случае условие будет инвертировано;
[*][B]SECTION_CODE[/B] - по мнемоническому коду родительской группы. Аналогично SECTION_ID;
[/LIST]Добавляете их или одно из них в массив $arFilter в вашем примере по аналогии с [B]IBLOCK_ID [/B](в дополнение к нему) и ага. [url=http://dev.1c-bitrix.ru/api_help/iblock/classes/ciblockelement/getlist.php]В документации лучше описано.[/url]