Вы явно не глубоко полезли. Нужно было лезть в классы. CIBlockCMLExport::ExportElements
[CODE]/bitrix/modules/iblock/classes/general/cml2.php:4180
$arFilter = array (
"IBLOCK_ID"=> $this->arIBlock["ID"],
"ACTIVE" => "Y",
">ID" => $this->next_step["LAST_ID"],
);
[/CODE]И убираете активность