При выгрузке заказов слетают методы оплаты и доставка

Аналогичная проблема! Теме больше года, кто как решал??

/home/bitrix/www/bitrix/modules/sale/lib/exchange > importonecpackage.php

766-776 строки комментируем

/**if(static::$config & static::DELETE_IF_NOT_FOUND_RELATED_PAYMENT_DOCUMENT)
{
$paymentResult = $this->onBeforePaymentCollectionModify($orderImport, $items);
if(!$paymentResult->isSuccess())
$result->addWarnings($paymentResult->getErrors());
}

$shipmentResult = $this->onBeforeShipmentCollectionModify($orderImport, $items);

if(!$shipmentResult->isSuccess())
$result->addWarnings($shipmentResult->getErrors());**/

778 строка согласно логике комментируем отгрузки и оплаты

/*|| !$shipmentResult->isSuccess() || !$paymentResult->isSuccess()*/

Уже несколько раз замечала, что такое случается, когда проставлены галки в Магазин-Настройки-Интеграция с 1С на пунктах
"Создавать новые документы оплаты из 1с"
"Создавать новый документы доставки из 1с".

И когда выгружать заказ в статусе "Новый".

В общем, пришлось подстраиваться под эти галки, ядро править жалко.

Отгрузки и оплаты удаляются при обмене, в случае если из 1с выгружается заказ без привязанных реализации и ПКО. Кажется нашли выход, в настройке обмена документами в модуле обмена настроили отбор, чтобы заказы вообще не выгружались из 1с. Тогда ничего не удаляется на сайте
Работаем только на сайте, там же нажимаем Отгружено/Оплачено, и реализация или ПКО проводится в 1с
Метод требует проверки, пока как идея