У меня такая же ситуация была:
т.к. архив состоит из 4х файлов, а при восстановлении из файла на локальном компьютере, копируется только *,tar.gz, а *.tar.gz.1 - *.tar.gz.4 не копировались. Поднял ftp и миднайт коммандером скопировал архивы, и из "корня" восстановил бэкап.
После чего сайт заработал.
Скопируйте все файлы архива на сервер битрикса, в папку /home/bitrix/www/, потом используйте пункт для восстановления бекапа "Архив загружен в корневую папку сервера"