По ссылке что вы указали слева скорее всего используется компонент меню + bitrix:menu.sections с подключенными разделами нужного инфоблока. Соответственно в первом уровне меню - показываются заглавные папки инфоблока, расположенные в первом уровне, а в подменю - вложенные папки - попробуйте так же.