Настроена многосайтовость по второму способу. В корне каждого сайта есть индексная страница. И так получается что у обоих сайтов для индексных страниц отдельный шаблон, а для разделов - другой. Естественно шаблоны для индексных страниц сайтов разные. Как я не крутил и условия писал и индекс сортировки у сайтов менял, а всё равно шаблон для первого сайта применяется ко второму. Помогите кто знает.
Только Хард-кор