При установки параметра каталога AJAX_MODE=>Y в шаблоне компонента catalog.element javascript скрипты не отрабатывают. Скрипты подключал через BX.addCustomEvent('onAjaxSuccess' и через BX.ready. Если отключить AJAX_MODE то все работает, если скрипты поместить в BX.addCustomEvent('onAjaxSuccess', то при переходе по ссылка скрипты отрабатывают, а при полной перезагрузки страницы не работают.