Конкретика нужна.
Для начала, нужно проверить, не было ли у вас модифицировано ядро.
Потом, если ядро модифицированно - устранить модификации.
Накатить обновления - по крупному ничего отвалиться не должно, мелочи можно поправить (там может отвалиться обмен с 1С в некоторых случаях)
Затем уже постепенно подключать тот функционал, возможность использования которого появилась в версии 12.5
Для начала, нужно проверить, не было ли у вас модифицировано ядро.
Потом, если ядро модифицированно - устранить модификации.
Накатить обновления - по крупному ничего отвалиться не должно, мелочи можно поправить (там может отвалиться обмен с 1С в некоторых случаях)
Затем уже постепенно подключать тот функционал, возможность использования которого появилась в версии 12.5
