Спасибо!
Все перепроверили еще раз, когда перепроверяли "интеграция с 1с-предприятие" (***/bitrix/admin/1c_admin.php?lang=ru&tabControl_active_tab=edit_catalog), сняли галочку с "При выгрузке учитывать тип инфоблока", после обмена новые каталоги плодиться перестали.
Буду впредь внимательнее!