Олег Сапегин пишет: Я так понял, что при удалении скажем инфоблока, или созданных в нем элементов, разделов, информация о них не удалается из самой базы данных mysql?
Хм. У Вас действительно так? Значит у Вас что-то сломалось.... При удалении элементов и разделов, они удаляются из таблиц. Связанные элементы надо удалять отдельно, т.к. эти элементы могут быть привязаны к другим элементам.
Может быть всё, что угодно. Не видя проект очень сложно сказать. А самый идеальный вариант - увидеть проект "изнутри", чтобы посмотреть настройки и что есть....
Alex G пишет: В Битриксе я не специалист, но сверстать сайт и написать к нему CMS на PHP могу
Тогда зачем Вам 1С-Битрикс? В итоге опять получится, что Битрикс - непонятно-что-на-палочке и ещё один (?) сайт который работает не через голову.... /извините, вырвалось.... imho....