Однозначно, что-то утверждать сложно, полагаю в рамках форума помочь в Вашем случае затруднительно.
Попробуйте повлиять на это:
1. Возможно проблема с диском или нечто влияющие на, посмотрите в munin если есть, что происходит с дисками. Возможно, что запросы выполняются медленно именно из-за ожидания обращений к дискам:
| Created_tmp_disk_tables | 222355 |
| Created_tmp_files | 185 |
| Created_tmp_tables | 992207
если это действительно так, и диски исправны, то либо tmpfs в памяти делать или переходить на ssd
2. Полагаю это тоже проблема требующая внимания:
| Aborted_clients | 1802
3. Думаю стоит увеличить размер журналов:
| Innodb_log_waits | 5 |
| Innodb_log_write_requests | 9642743 |
| Innodb_log_writes | 2602257
Попробуйте повлиять на это:
1. Возможно проблема с диском или нечто влияющие на, посмотрите в munin если есть, что происходит с дисками. Возможно, что запросы выполняются медленно именно из-за ожидания обращений к дискам:
| Created_tmp_disk_tables | 222355 |
| Created_tmp_files | 185 |
| Created_tmp_tables | 992207
если это действительно так, и диски исправны, то либо tmpfs в памяти делать или переходить на ssd
2. Полагаю это тоже проблема требующая внимания:
| Aborted_clients | 1802
3. Думаю стоит увеличить размер журналов:
| Innodb_log_waits | 5 |
| Innodb_log_write_requests | 9642743 |
| Innodb_log_writes | 2602257